Die Kirche von Sankt Franziskus von Assisi liegt heute in der Stelle, wo der Heilige begraben sein wollte, in dem Gebiet von Assisi, die im Mittelalter als "Hügel der Hölle" bekannt war, das heißt der Ort, wo an jener Zeit die öffentlichen Hinrichtungen statt fanden.

Die Baustelle der Basilika von Sankt Franz von Assisi wurde 1228 zu dem Wille von Papst Gregor IX und dank der Tätigkeit von Bruder Elia, ein Vikar des Ordens von Sankt Franz von Assisi, geöffnet.
Die architektonische Struktur der unteren Basilika von Assisi wurde schon nach zwei Jahre beendet und nach sechs Jahre wurde die obere Basilika von Sankt Franz eröffnet.
Das jetzige Aussehen ist jedoch das Ergebnis von vielen Arbeiten wie die Ausführung des Glockenturmes mit Giebeln (1239), die Errichtung von einem Laubengang vor der unteren Basilika ('400)und von einem Steinatrium für das Portal der unteren Basilika (1445), und die Entfernung der Giebel aus dem Glockenturm(1518).
Das Gebäude besteht aus zwei übereinanderliegenden Kirchen: die obere Kirche ist gotisch, hell und hoch, die untere ist dagegen niedrig und schmucklos und wird durch ein gotisches Portal des dreizehnten Jahrhunderts erreicht.
Hier, in dem einschiffigen Raum mit Querschiff sind die wunderbaren "allegorische Fresken" von Giotto, die "Madonna Engel und Sankt Franz" und die "Fünf Heiligen" von Simone Martini, die "Episoden aus dem Leben und Passion Christi", die "Madonna und Heiligen" und die "Wundmale Christi" von Lorenzetti.
Werke von Simone Martini und Giotto sind auch beziehungsweise in der ersten rechten Kapelle, wo das "Leben von Sankt Martin" sich befindet, und in der dritten Kapelle mit "Heiligen und Geschichte von der Madonna". 1818, nach der Ausgrabung unter dem Altar wurden die irdischen Reste des Heiligen gefunden und nach einer gewissenhaften Überprüfung wurden sie anerkennt; zwei Jahre später, zu dem Wille von Papst Pio IX, wurde die Aufbau der Krypta in neuklassizistischem Stil in der unteren Basilika eingeleitet.
Das jetzige Aussehen ist jedoch das Ergebnis eines Vereinfachungswerkes, das im Jahr 1920 statt fand. Die obere einschiffige Kirche mit Apsis und raffinierten Glasfenstern aus dem dreizehnten Jahrhundert ist mit Fresken des Zyklus "Das Leben des Heiligen" - Giotto, die zwischen 1296 und 1300 gemalt wurden, mit den "Geschichte aus dem Alten und Neuem Testament" aus der Cimabue - Schule bemalt und in dem Querschiff, in der Vierung und in der Apsis mit Cimabue - Freskos , die 1277 zurückreichen. Andere Werke Meister wie Cavallini und Torriti reichen 1277 zurück.

Opening hours of Basilic:
Lower Basilic
Sun time 6.00am - 6.00pm; Summer time 6.00am - 6.45pm
Upper Basilic
Sun time 8.30am - 6.00pm; Summer time 8.30am - 6.45pm

Weekdays timetable
Holy Masses
Morning 7.00/11.00; Afternoon 5.00 (Summer time 6.00)

Holydays
Holy Masses in Lower Basilica
Morning 7.30/9.00/10.30; Afternoon 5.00/6.30
Morning 12.00 Lower Basilic (Summer time in the Upper Basilica)