La basílica de Sant'Ubaldo tiene cinco naves y fue restaurada en el 1500 por los Canónigos Reglares Lateranenses a los cuales se ocupaban de la custodia del sanctuario.

Notables son el altar en mármol y los ventanales historiados con episodios de la vida del santo patrón de Gubbio, el cuyo cuerpo incorrupto está expuesto en una urna de cristal encima del altar.
Los portales finamente esculpidos así como los fragmentos de frescos en las paredes del claustro muestran todavía la antigua magnificencia de las decoraciones del siglo XVI. En la basílica, desde la noche del 15 de mayo de cada año hasta el primero domingo de mayo del año sucesivo, se conservan, en la nave de derecha, los "Ceri".