L'église de Sainte Claire d'Assise a été construite en style gothique italien entre 1257 et 1265, le long de l'axe routier qui relie la Porte Nouvelle à St. François.

La basilique de Sainte Claire d'Assise, réalisée avec la typique pierre rose extraite des carrières du Mont Subasio, contient de précieuses fresques datant de la période qui va du XIIème au XIVème siècles.
Dans la première chapelle à droite le long de l'unique nef de Sainte Claire d'Assise, finissant en transept et abside polygonale, on peut admirer le Crucifix qui, selon la tradition, aurait invité Saint François dans l'église de St. Damiano à "rebâtir l'Eglise".
Cette chapelle et celle d'après sont les restes de la préexistante église de St.Georges et en tant que telles elles représentent la zone la plus ancienne de l'édifice. Dans la crypte sont conservées les restes terriens de Sainte Claire d'Assise et certaines reliques particulièrement bien conservées: un vêtement de Saint François et une veste réalisée par la Sainte, entre autres.
De la Place devant l'église, caractérisée par la présence d'arcs rampants sur le côté de l'édifice et de la façade avec rosace centrale, on peut admirer un vaste panorama et, pendant les journées de ciel dégagé, on peut embrasser d'un seul regard la vallée ombrienne de Montefalco à Pérouse.
Née en 1194 d'une famille noble de l'endroit, la petite fille est baptisée Claire dans l'église de Saint Rufin, puisque la mère, quand elle s'était recueillie en prière peu de jours avant l'accouchement, avait entendu une voix lui annoncer qu'elle aurait donné au monde une "claire lumière" pour l'illuminer.
Pendant les années d'éducation, la jeune fille suivit également les croisés en Terre Sainte; cependant, c'est la nuit du dimanche des rameaux, le 18 mars 1212, qui fût l'expérience qui détermina un changement radical dans le cours de sa vie; cette nuit-là en effet, la jeune fille rejoignit en cachette St.François à la Porziuncola. Comme rituels d'initiation en signe de pénitence elle fût revêtit du vêtement franciscain et ses cheveux furent coupés.
Pendant plus de quarante ans elle se retira à la vie monacale à Saint Damiano en-dehors des murs dans une extrême pauvreté et simplicité. Sa "Règle" fût officiellement approuvée en 1252 par le Pape Innocent IV, le quel, arrivé à St. Damiano pour lui donner la bénédiction à l'Ordre des Clarisses dut également présider à serites funèbres le 11 août 1253.
Le rite fut toutefois caractérisé par le fait que le Pape ne veuille qu'on chante la messe de requiem mais le rite festif des vierges.